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原因很简单：

HTML 文档中，多个空白字符等价为一个空白字符。也就是说换行等空白字符的删除是不安全的，有可能导致部分元素的样式产生差异。
HTML 元素中，有一个pre, 表示 preformatted text. 里面的任何空白，都不能被删除。
HTML 中有可能有 IE 条件注释。这些条件注释是文档逻辑的一部分，不能被删除。
只想到以上 3 点，可能还有其它陷进。对于动态页面来说，HTML 的压缩有可能还会增加服务器的 CPU 负担，得不偿失。

一般来说，通过 gzip 压缩已经能达到很好的效果。进一步的压缩存在陷进，除非能像 Google 一样充分测试（Google 也仅压缩了少部分核心服务的页面），否则不推荐对 HTML 进行压缩处理。